Câu chuyện bắt đầu khi Liên minh Giải phóng Động vật (ALA), một tổ chức khủng bố sinh thái, tấn công một phòng thí nghiệm nghiên cứu sinh học và giải cứu một con tinh tinh đang mang thai. Con tinh tinh này sau đó sinh ra Charlie, một sinh vật lai giữa người và tinh tinh (được gọi là "Humanzee"). Charlie được một cặp vợ chồng loài người nhận nuôi và lớn lên trong môi trường con người. Sau 15 năm, cậu bắt đầu đi học trung học, nơi cậu kết bạn với Lucy Eldred, một cô gái thông minh nhưng bị cô lập....

Sau khi tỉnh dậy sau một giấc ngủ đông dài, Akira Himegami, một học sinh trung học, thấy mình lạc vào một thế giới mà cậu không còn nhận ra. Thành phố chỉ còn là đống đổ nát sau chiến tranh, xã hội giờ đây được cai trị bởi một tổ chức tên là OWEL, và hôn nhân truyền thống đã được thay thế bằng một hệ thống mới mang tên "Elsie". Trong lúc Akira đang vật lộn để hiểu được tương lai đã thay đổi chóng mặt này, một hình bóng quen thuộc xuất hiện trước mắt cậu—Yuugure, người có ngoại hình rất giống bạn...