Bộ phim Chuyến Tàu Khủng Bố - Red Line kể về một chuyến tàu điện ngầm ở Los Angeles bất ngờ gặp tai nạn khiến những người sống sót bị chôn vùi dưới đống đổ nát. Bị mắc kẹt trong tuyệt vọng, những người sống sót nhận ra rằng kẻ đã cho nổ bom là một trong số họ. Sự nghi ngờ lẫn nhau bắt đầu xuất hiện trong cuộc chiến sinh tồn này.

Phim kể về bữa tiệc chia tay của Giáo sư John Oldman trước khi quyết định về hưu, ông đã tiết lộ cho những người bạn của mình, ông là một người bất tử đã sống trên trái đất suốt 14.000 năm. Ông kể ông đã từng đi thuyền với Ma-gen-lăng, đã gặp đức Phật, đã trải qua tất cả các biến cố của lịch sử, và đỉnh điểm, thật ra ông chính là...

Archer và phi hành đoàn phải chiến đấu với những con người biến đổi gen, kích động một cuộc cách mạng Vulcan và thống nhất các chủng loài đang gây chiến.

Một cuộc tấn công Trái Đất dẫn tàu Enterprise đến Expanse, một khoảng trống không gian rộng lớn, nơi trú ẩn của Xindi, một nhóm chủng tộc đang tìm cách xóa sổ loài người.

Archer bị lún sâu hơn vào Chiến tranh lạnh tạm thời, giáp mặt với lũ Borg và người Romulan, đồng thời biết rằng tộc Klingon đã treo thưởng cho thủ cấp của anh ta.

Thuyền trưởng Archer cùng phi hành đoàn thám hiểm không gian, khám phá công nghệ tiên tiến của con người và gặp các chủng tộc mới trong phần tiền truyện "Star Trek" này.