Một nhiệm vụ thất bại đưa Nhím Sonic, các bạn, bác sĩ Eggman và 7 viên Ngọc lục bảo Hỗn loạn tới một chiều không gian khác: Trái Đất.

Eggman giải phóng thần hủy diệt Hỗn loạn đã bị phong ấn 4.000 năm. Hắn gia nhập đội quân Nhím Shadow và rắp tâm trả thù nhân loại.