Có một mảnh đất huyền bí mà ở đó, loài người và các Pokémon sống hòa thuận, luôn kề vai sát cánh, chiến đấu cùng nhau trong các giải đấu. Và tại thị trấn Masara thuộc vùng Kanto, cậu bé 10 tuổi Satoshi với ước mơ trở thành một người huấn luyện Pokémon, chu du khắp mọi miền và giành được danh hiệu “Chuyên gia Pokémon”. Nhưng mọi chuyện không hề dễ dàng với Satoshi tại buổi chọn lựa Pokémon đầu tiên khi cậu đến muộn và chỉ còn sót lại Pikachu. Cuộc sống của Satoshi cũng từ đó bị đảo lộn hoàn toàn...

Một kẻ tự xưng là siêu trộm Kaito Deluxe (DX) đã đột nhập vào nhà Nobita lúc nửa đêm và lấy đi quả chuông của Doraemon. Điều này đưa Nobita và nhóm bạn vào cuộc phiêu lưu tại một nơi mang tên "Viện Bảo Tàng Bảo Bối Tương Lai", đây là nơi lưu giữ tất cả các bảo bối tại thế kỷ 22. Cuộc điều tra trở nên phức tạp và kỳ lạ hơn khi có sự xuất hiện của những nhân vật mới.

Nobita được mua cho một con bọ cánh cứng, Nobita đem nó đi đấu với Jaian nhưng lại bị thua nên Nobita nhờ Doraemon bắt cho mình một con khác để phục thù,trong lúc dò tìm bọ cánh cứng cho Nobita không may lại bắt dính loài khổng điểu cổ đại. Lo sợ khi đưa nó về thế giới cổ đại cũng sẽ diệt vong nên nhóm Doraemon đưa nó đến một nơi có tên là đảo Beregamondo. Ở đây nhóm bạn đã gặp người quản lý đảo, cô tiến sĩ Kelly. Do sơ suất nên Doraemon bị con khổng điểu lấy mất gậy lãng quên. Con khổng điểu ấy...

Với sự phát triển của công nghệ, một trò chơi mới ra đời và chỉ được giành cho các con cháu của quan chức Nhật Bản. Conan và Đội Thám Tử Nhí lớp 1B cũng có cơ hội được mời đến tham gia trò chơi máy tính ảo mới này. Tuy nhiên, người lập trình trò chơi đã phát biểu rằng nếu mọi người không thể trả lời câu đố trong trò chơi, tất cả họ đều phải chết. Conan nhanh chóng nhận ra đây là một cạm bẫy nguy hiểm đến tính mạng, cậu buộc phải chiến thắng để cứu mọi người. Liệu trò chơi ma quái này có buông th...