Tổ chức mới do Fyodor D tà ác cầm đầu bắt đầu nổi lên, đe dọa Atsushi, Dazai và Cơ quan thám tử vũ trang ngay cả khi họ chưa thoát khỏi tàn dư của Hiệp Hội.

Một thanh niên trẻ tham gia Cơ quan thám tử vũ trang, gồm các thành viên dùng siêu năng lực để giải quyết các bí ẩn và ngăn chặn kế hoạch tà ác của Tổ chức Mafia cảng.

Mâu thuẫn giữa Cơ quan thám tử vũ trang và Tổ chức Mafia cảng vẫn tiếp diễn. Trong lúc đó, phe thứ ba, Hiệp Hội, đe dọa tiến hành một cuộc chiến chống lại cả hai.

Yukina Shirahane, một học sinh trung học năm hai, chứng kiến một con mecha tấn công viện nghiên cứu của mẹ mình và được một cậu thiếu niên cư xử ý hệt samurai giải cứu.

Bí ẩn càng tăng thêm khi một nhân vật phản diện xuất hiện và không từ thủ đoạn nào để giết chết Ken. Nhưng cô ấy trông giống như công chúa mà Ken đã thề bảo vệ.